서울대병원 연구팀이 희귀 유전질환이 의심돼 진료를 받은 환자를 대상으로 전장 유전체 분석(Genome Sequencing, GS)을 시행한 결과, 가구 기준 46.2%에서 질환의 유전적 원인을 규명한 것으로 나타났다. 이 가운데 14.6%는 기존 유전자 검사로는 진단이 어려웠던 사례로, 전장 유전체 분석을 통해서만 원인 확인이 가능했다.
서울대병원 임상유전체의학과 채종희·이승복·김수연 교수 연구팀과 쓰리빌리언 서고훈 박사 연구팀은 서울대병원에서 희귀 유전질환이 의심돼 진료를 받은 국내 1,452가구(총 3,317명)를 대상으로 전장 유전체 분석을 시행하고, 희귀 유전질환의 진단 성과와 임상적 활용 가능성을 분석한 연구 결과를 30일 발표했다.
희귀 유전질환은 현재까지 약 5,000~8,000종이 보고돼 있으며, 질환의 원인이 되는 유전 변이를 확인하는 것이 정확한 진단과 치료 관리의 핵심으로 꼽힌다. 그러나 기존의 엑솜 시퀀싱이나 유전자 패널 검사는 유전체 일부만을 분석해 구조 변이, 비암호화 영역 변이, 반복서열 확장 변이 등 주요 원인 변이를 확인하는 데 한계가 있었다.
연구팀은 이러한 한계를 보완하기 위해 유전체 전체를 분석하는 전장 유전체 분석을 적용했다. 환자의 주요 증상을 기준으로 질환 유형을 분류한 뒤 말초혈액을 이용해 분석을 진행했으며, 분석 결과는 증상과 유전자 변이의 연관성에 따라 진단·진단 가능·미진단으로 구분했다. 진단 여부 평가는 가구당 대표 환자 1명을 기준으로 이뤄졌다.
분석 결과, 전체 1,452가구 중 672가구(46.2%)에서 질환의 원인이 되는 유전자 변이가 확인됐다. 이 중 진단이 확정된 경우는 43.5%, 진단 가능으로 분류된 경우는 2.8%였다.
특히 진단된 672가구 가운데 98가구(14.6%)는 전장 유전체 분석으로만 질환 원인을 확인할 수 있었다. 이들 사례에서는 기존 검사로 확인이 어려운 딥인트론 변이, 비암호화 영역 변이, 구조 변이, 반복서열 확장 변이가 주요 원인으로 나타났다.
가족 구성원을 포함해 분석한 경우(Duo·Trio·Quad+Penta) 진단율은 48.5%로, 환자 단독 검사(41.5%)보다 높았다. 다만 가족 검사가 반드시 필요했던 경우는 진단 가구의 7.5%에 그쳐, 환자 1인만을 대상으로 한 전장 유전체 분석 역시 희귀 유전질환의 1차 진단 검사로 충분한 효율성을 보인 것으로 분석됐다. 질환 유형별로는 신경근육질환과 신경 발달 장애에서 높은 진단율이 나타났다.
또한 전체 검사 대상자 3,317명 가운데 4.3%에서는 심근병증·부정맥, 암 발생 위험 증가 등 건강에 영향을 미칠 수 있는 병원성 유전자 변이가 추가로 발견됐다.
질환 원인이 규명된 환자 중 18.5%(124명)에서는 유전자 진단 결과를 바탕으로 장기적인 치료 또는 관리 계획이 수립됐으며, 지텔만 증후군, 전신 농포성 건선 환자 등에서는 맞춤형 치료가 실제 진료에 적용됐다.
채종희 교수는 “이번 연구는 전장 유전체 분석이 기존 검사로 진단에 이르지 못했던 희귀 유전질환 환자에서 원인 규명에 효과적으로 활용될 수 있음을 국내 최대 규모 환자군에서 확인한 결과”라며 “보다 정확한 유전 진단을 통해 환자의 진단 여정을 단축하고, 조기 치료와 맞춤형 관리로 이어지기를 기대한다”고 밝혔다.
한편 이번 연구 결과는 유전자 기반 질병 연구 및 정밀의학 분야 국제 학술지 ‘NPJ Genomic Medicine’ 최근호에 게재됐다.
